UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1NACAn/a
    
    
     
6e-95chr12 56,719,815Homo sapiens nascent polypeptide associated complex subunit alpha (NACA), transcript variant 4, mRNA. (from RefSeq NM_001113202)
2AC117378.1n/a
    
    
     
n/achr12 56,728,073Synthetic construct DNA, clone: pF1KB0958, Homo sapiens PRIM1 gene for primase, DNA, polypeptide 1, without stop codon, in Flexi system. (from mRNA AB528338)
3AC007969.1n/a
    
    
     
n/achr2 171,517,493Sequence 279 from Patent EP3253886. (from mRNA LP895415)
4RPL7n/a
    
    
     
n/achr8 73,291,937Homo sapiens ribosomal protein L7 (RPL7), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_000971)
5RPL17n/a
    
    
     
n/achr18 49,490,503Homo sapiens ribosomal protein L17 (RPL17), transcript variant 9, mRNA. (from RefSeq NM_001369555)
6AL009174.1n/a
    
    
     
n/achrX 133,671,178AL009174.1 (from geneSymbol)
7NSA2n/a
    
    
     
n/achr5 74,773,681Homo sapiens NSA2 ribosome biogenesis factor (NSA2), transcript variant 6, non-coding RNA. (from RefSeq NR_157206)
8RPL37n/a
    
    
     
n/achr5 40,830,242Homo sapiens ribosomal protein L37 (RPL37), transcript variant 2, non-coding RNA. (from RefSeq NR_159993)
9EIF3En/a
    
    
     
n/achr8 108,372,177eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E (from HGNC EIF3E)
10HNRNPA1n/a
    
    
     
n/achr12 54,283,640Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 (HNRNPA1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_002136)
11VCPn/a
    
    
     
n/achr9 35,064,344Homo sapiens valosin containing protein (VCP), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007126)
12PCBP2n/a
    
    
     
n/achr12 53,466,004Homo sapiens poly(rC) binding protein 2 (PCBP2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_031989)
13AC023509.1n/a
    
    
     
n/achr12 53,454,634Homo sapiens cDNA FLJ58476 complete cds, highly similar to Poly(rC)-binding protein 2. (from mRNA AK296930)
14AC023509.4n/a
    
    
     
n/achr12 53,464,810Homo sapiens lncRNA (TUC338) gene, complete sequence. (from mRNA KF041153)
15PCBP2-OT1n/a
    
    
     
n/achr12 53,464,762Homo sapiens PCBP2 overlapping transcript 1 (PCBP2-OT1), long non-coding RNA. (from RefSeq NR_109828)
16XRCC5n/a
    
    
     
n/achr2 216,156,883Single stranded DNA-dependent ATP-dependent helicase.  Has a role in chromosome translocation. The DNA helicase II  complex binds preferentially to fork-like ends of double-stranded  DNA in a cell cycle-dependent manner. It works in the 3'-5'  direction. Binding to DNA may be mediated by XRCC6. Involved in  DNA non-homologous end joining (NHEJ) required for double-strand  break repair and V(D)J recombination. The XRCC5/6 dimer acts as  regulatory subunit of the DNA-dependent protein kinase complex  DNA-PK by increasing the affinity of the catalytic subunit PRKDC  to DNA by 100-fold. The XRCC5/6 dimer is probably involved in  stabilizing broken DNA ends and bringing them together. The  assembly of the DNA-PK complex to DNA ends is required for the  NHEJ ligation step. In association with NAA15, the XRCC5/6 dimer  binds to the osteocalcin promoter and activates osteocalcin  expression. The XRCC5/6 dimer probably also acts as a 5'-  deoxyribose-5-phosphate lyase (5'-dRP lyase), by catalyzing the  beta-elimination of the 5' deoxyribose-5-phosphate at an abasic  site near double-strand breaks. XRCC5 probably acts as the  catalytic subunit of 5'-dRP activity, and allows to 'clean' the  termini of abasic sites, a class of nucleotide damage commonly  associated with strand breaks, before such broken ends can be  joined. The XRCC5/6 dimer together with APEX1 acts as a negative  regulator of transcription. (from UniProt P13010)
17EIF3Kn/a
    
    
     
n/achr19 38,628,071Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K (EIF3K), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_013234)
18PSMA7n/a
    
    
     
n/achr20 62,140,063Homo sapiens proteasome subunit alpha 7 (PSMA7), mRNA. (from RefSeq NM_002792)
19EEF1Dn/a
    
    
     
n/achr8 143,588,686Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 1 delta (EEF1D), transcript variant 3, mRNA. (from RefSeq NM_001130053)
20CTDNEP1n/a
    
    
     
n/achr17 7,247,849Serine/threonine protein phosphatase forming with  CNEP1R1 an active phosphatase complex that dephosphorylates and  may activate LPIN1 and LPIN2. LPIN1 and LPIN2 are phosphatidate  phosphatases that catalyze the conversion of phosphatidic acid to  diacylglycerol and control the metabolism of fatty acids at  differents levels. May indirectly modulate the lipid composition  of nuclear and/or endoplasmic reticulum membranes and be required  for proper nuclear membrane morphology and/or dynamics. May also  indirectly regulate the production of lipid droplets and  triacylglycerol. May antagonize BMP signaling. (from UniProt O95476)
21RPL12P16n/a
    
    
     
n/achr2 203,191,028ribosomal protein L12 pseudogene 16 (from HGNC RPL12P16)
22EIF3Dn/a
    
    
     
n/achr22 36,520,010Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D (EIF3D), transcript variant 2, non-coding RNA. (from RefSeq NR_156418)
23EEF1B2P3n/a
    
    
     
n/achrX 24,788,730eukaryotic translation elongation factor 1 beta 2 pseudogene 3 (from HGNC EEF1B2P3)
24CCT739664
    
    
     
n/achr2 73,243,656Homo sapiens chaperonin containing TCP1 subunit 7 (CCT7), transcript variant 5, non-coding RNA. (from RefSeq NR_029402)
25HMGN2n/a
    
    
     
n/achr1 26,474,541Homo sapiens high mobility group nucleosomal binding domain 2 (HMGN2), mRNA. (from RefSeq NM_005517)
26ATP5MC2n/a
    
    
     
n/achr12 53,671,289Homo sapiens ATP synthase membrane subunit c locus 2 (ATP5MC2), transcript variant 5, mRNA. (from RefSeq NM_001369754)
27AC073594.1n/a
    
    
     
n/achr12 53,632,969AC073594.1 (from geneSymbol)
28HNRNPA1P48n/a
    
    
     
n/achr16 51,600,108heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 48 (from HGNC HNRNPA1P48)
29HNRNPUn/a
    
    
     
n/achr1 244,857,428Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U (HNRNPU), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_004501)
30SF3B1n/a
    
    
     
n/achr2 197,412,437Homo sapiens splicing factor 3b subunit 1 (SF3B1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_012433)
31EIF4Bn/a
    
    
     
n/achr12 53,024,183Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4B (EIF4B), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001417)
32FBLn/a
    
    
     
n/achr19 39,840,418Homo sapiens fibrillarin (FBL), mRNA. (from RefSeq NM_001436)
33PTGES3n/a
    
    
     
n/achr12 56,675,816Homo sapiens prostaglandin E synthase 3 (PTGES3), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_006601)
34NONOn/a
    
    
     
n/achrX 71,292,400Homo sapiens non-POU domain containing octamer binding (NONO), transcript variant 3, mRNA. (from RefSeq NM_001145409)
35EIF4G1n/a
    
    
     
n/achr3 184,324,924Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 (EIF4G1), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_198241)
36TMEM14Cn/a
    
    
     
n/achr6 10,727,017Homo sapiens transmembrane protein 14C (TMEM14C), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001165258)
37CTTNn/a
    
    
     
n/achr11 70,417,494Homo sapiens cortactin (CTTN), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_138565)
38TRIM28n/a
    
    
     
n/achr19 58,547,389Homo sapiens tripartite motif containing 28 (TRIM28), mRNA. (from RefSeq NM_005762)
39BANF1n/a
    
    
     
n/achr11 66,003,187Homo sapiens barrier to autointegration factor 1 (BANF1), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001143985)
40RBM39n/a
    
    
     
n/achr20 35,721,803Homo sapiens RNA binding motif protein 39 (RBM39), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_184234)
41C12orf57n/a
    
    
     
n/achr12 6,945,012Homo sapiens chromosome 12 open reading frame 57 (C12orf57), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_138425)
42RNU7-1n/a
    
    
     
n/achr12 6,943,847Homo sapiens RNA, U7 small nuclear 1 (RNU7-1), small nuclear RNA. (from RefSeq NR_023317)
43CTDSP2n/a
    
    
     
n/achr12 57,833,328Homo sapiens CTD small phosphatase 2 (CTDSP2), mRNA. (from RefSeq NM_005730)
44CAPZBn/a
    
    
     
n/achr1 19,412,157Homo sapiens capping actin protein of muscle Z-line subunit beta (CAPZB), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_004930)
45HNRNPA3n/a
    
    
     
n/achr2 177,216,324Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 (HNRNPA3), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_194247)
46MIR4444-1n/a
    
    
     
n/achr2 177,212,762Homo sapiens microRNA 4444-1 (MIR4444-1), microRNA. (from RefSeq NR_039646)
47SNRPD2n/a
    
    
     
n/achr19 45,689,893Required for pre-mRNA splicing. Required for snRNP  biogenesis (By similarity). (from UniProt P62316)
48PSMB1n/a
    
    
     
n/achr6 170,544,213Homo sapiens proteasome subunit beta 1 (PSMB1), mRNA. (from RefSeq NM_002793)
49SF3B523539
    
    
     
n/achr6 144,095,228Homo sapiens splicing factor 3b subunit 5 (SF3B5), mRNA. (from RefSeq NM_031287)
50PSMB6n/a
    
    
     
n/achr17 4,797,329Homo sapiens proteasome subunit beta 6 (PSMB6), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_002798)